Пройшло 15 років після загадкової глобальної катастрофи, що поставила людство на грань виживання. Але тих, що залишилися в живих попереду чекають ще страшніші випробування. Землю атакують «Ангели», загадкові велетенські істоти, що з’явилися невідомо звідки. Єдина зброя на планеті, здатна їм протистояти, — роботи серії «Євангеліон», створені за допомогою передової біотехнології. Правда, битися за допомогою цих величезних машин здатні тільки ті пілоти, які можуть повністю «синхронізувати» себе з роботом і управляти «Євангеліоном» як власним тілом. Ці унікальні бійці навчаються і живуть в секретному підземному місті Токіо-3, штаб-квартирі організації «NERV» Землі, що очолює захист, від вторгнення. Шінджі, Аска і Рей — пілоти, між якими складаються украй непрості стосунки. Але саме від них залежить доля планети і розгадка таємниці зловісних «Ангелів»