Дія серіалу розгортається в 2369-2375 роках на космічній станції «Далекий Космос 9» , яка знаходиться на орбіті тільки що звільненої від окупації Кардассіанської Імперії планети Баджор. Випадково в безпосередній близькості від станції виявляється просторова аномалія - коридор, що зв'язує Баджор з Гамма-квадрантом галактики. Це відкриття перетворює «Глибокий Космос 9» з фактично непотрібної станції в торговий центр. Зовсім зненацька через аномалію на орбіту Баджора ступають війська нового ворога - Домініона. Станція «Глибокий Космос 9» під командуванням Бенджаміна Сіско фактично опиняється на передовій воєнних дій і стає головною опорною точкою військ Федерації та її союзників...